从南到北—— 耐药肠伤寒沙门氏菌全球传播轨迹
伤寒继续威胁着全球数千万人的健康和生命,而耐药伤寒沙门氏菌的持续进化很可能使伤寒的预防、控制和治疗变得更加困难。最近发表在《柳叶刀微生物》上的一项研究表明,广泛耐药、耐喹诺酮或阿奇霉素的伤寒菌株在伤寒发病率高的地区迅速增加,例如南亚,这些菌株在国际上经常流行并具有迁徙性。
伤寒的耐药性继续有增无减。伤寒是由伤寒沙门氏菌引起的胃肠道感染,通常通过受污染的食物或水传播。每年,伤寒在全球范围内感染超过1100 万人,并导致超过10 万人死亡[2-4]。尽管已有伤寒疫苗,但伤寒仍然是世界各地主要的公共卫生问题之一,特别是在南亚,伤寒约占全球伤寒疾病的70%。
近半个世纪以来,伤寒抗菌治疗的有效性一直受到耐药菌株的威胁。
多重耐药菌株(MDR)首次出现于20世纪70年代,携带氨苄西林、氯霉素和甲氧苄啶-磺胺甲恶唑耐药基因,随后由H58单倍型(4.3.1)多重耐药菌株发展而来,已成为全球主流种群。
20世纪90年代,氟喹诺酮类药物仍然对多重耐药菌株有效,是当时的主要治疗选择。
2010年,大多数南亚伤寒菌株都含有针对喹诺酮耐药决定区(QRDR)的突变。
2023年,巴基斯坦大规模伤寒疫情中发现了广泛耐药(XDR)菌株。该菌株可以通过质粒介导的耐药性和染色体上存在的多个药物编码基因对第三代头孢菌素和氟喹诺酮类药物产生耐药性。反抗。
2023年,在多个伤寒谱系中发现了由AcrB外排泵基因引起的阿奇霉素耐药性。
耐药伤寒菌株的全球传播为了更好地了解耐药伤寒菌株在全球范围内的时间和地理传播情况,美国斯坦福大学和其他机构的研究人员对发病率最高的四个南亚国家(孟加拉国)进行了研究。从印度、尼泊尔和巴基斯坦(2014-2023 年)确诊的伤寒病例的血液样本中提取了3,489 个肠沙门氏菌分离株进行全基因测序,并从其他79 个以上国家(1905-2023 年)提取了4,169 个肠沙门氏菌分离株。 )数据被提取并排序以进行比较。
总体而言,南亚的多重耐药伤寒感染正在下降,但巴基斯坦除外,该国于2023 年出现了广泛耐药菌株(XDR),但耐药性较低的菌株正在迅速被取代。
伤寒沙门氏菌喹诺酮耐药决定区(QRDR) 的突变已独立出现至少94 个,且分布广泛,大多数发生在南亚。
具有多个QRDR 突变位点的菌株,包括具有高水平氟喹诺酮耐药性的三突变体(gyrA parC parE) 菌株,其频率正在增加,并正在被突变较少的菌株所取代。
2013年前后,孟加拉国出现了抗阿奇霉素的acrB突变株,且这些菌株的有效种群稳步增加。
有证据表明,耐药伤寒菌株在国际(138 例)和洲际(59 例)之间频繁流动,以及易感伤寒菌株的区域扩张和替代。如下图所示,几种广泛耐药菌株已从南亚传播到北美(黄线)、多种氟喹诺酮类耐药菌株(蓝线)、氟喹诺酮类耐药菌株和多重耐药菌株(红线) .线)从南亚传播。从亚洲到欧洲。
系统发育树推断:自1990 年以来非H58 和H58 伤寒菌株的地理移动(FQ-NS=氟喹诺酮不敏感,MDR=多重耐药,XDR=广泛耐药)
这项研究仅选取了南亚的四个国家,并未纳入其他伤寒高发地区的样本,例如撒哈拉以南非洲和大洋洲国家;尽管研究结果来自多个监测站,尚未具有广泛代表性,但研究结果表明,南亚的多重耐药伤寒菌株正在减少,耐药菌株广泛存在,并且高水平的耐药菌株已被氟喹诺酮或阿奇霉素耐药菌株所取代,表明这些菌株在国际上频繁流行。耐药细菌不断出现。
我国耐药伤寒情况我国虽不是伤寒主要流行区,但伤寒仍呈零星发生,发病高峰期为夏秋季节,以儿童和青少年为主。 2023年,我国伤寒、副伤寒感染人数为7011例,比2023年减少2263例;死亡人数为5例,比2023年增加5例[5]。
根据CHINET 2023数据监测,从耐药率来看,肠沙门氏菌和副伤寒91种抗生素耐药率最高的是氨苄青霉素(71.2%)、氨苄西林/舒巴坦(50.9%)、氯霉素(38.5%)。是。TMP-SMZ (26.1%)、头孢曲松(14.1%)、头孢他啶(11.7%) 和环丙沙星(10.6%) [6]。
CHINET 2023检测91种伤寒和副伤寒菌株的抗菌药物耐药率
2023年3月,《中国疾病预防控制中心周报》(CCDCweekly)报道了北京市昌平区因饮用水污染而发生大范围耐药伤寒沙门氏菌感染病例[7]。共有23名患者出现高烧、腹泻等症状。
研究人员最终在公寓水箱的出水口分离出一株肠沙门氏菌,其基因鉴定结果为H58菌株4.3.1.1.P1,源自巴基斯坦。药物敏感性测试显示对氨苄西林、氯霉素和甲氧苄啶耐药。 -磺胺甲恶唑。它产生超广谱-内酰胺酶(ESBL),对恶唑、氨曲南、链霉素、氟喹诺酮类、第三代和第四代头孢菌素耐药,仅对阿奇霉素、亚胺培南和美罗培南敏感。
总之,伤寒沙门氏菌仍然是全球公共卫生问题之一,特别是耐药菌株广泛存在,高水平的氟喹诺酮和阿奇霉素耐药菌株取代了多重耐药菌株,伤寒的负担正在蔓延。从地区到世界。南亚地区需加强耐药菌株溯源和监测研究。
参考
[1] da Silva, Kesia Esther 等人,抗菌药物耐药性沙门氏菌: 的国际和洲际流行和传播,《柳叶刀微生物》,2023 年6 月21 日发表DOI:https://doi.org/10.1016/S2666-5247(22 )00 093-3
[2] Dougan G, Baker S. 肠沙门氏菌血清型伤寒和伤寒的发病机制,Annu Rev Microbiol 2014, 68: 317-36。
[3] Antilln M、Warren JL、Crawford FW 等人,低收入和中等收入国家伤寒的负担:PLoS Negl Trop Dis 2023,e0005376。
[4] Stanaway JD、Reiner RC、Blacker BF 等人,伤寒和副伤寒的全球负担:2023 年全球疾病负担研究的系统分析。柳叶刀感染疾病2023;369-81。
[5] 杨九. 2023年中国伤寒、副伤寒病例、死亡、治疗及预防措施.华晶信息网.https://www.huaon.com/channel/trend/659345.html
[6] 91株伤寒、副伤寒杆菌耐药率。 https://www.chinets.com/Data/AntibioticDrugFast
[7] 王宇,陆丹,金英英等,水源性广泛耐药沙门氏菌暴发——中国北京,2023年1月-2月[J]中国疾病预防控制中心周刊,2023年。4(12): 254 -258。
(来源:《感染医线》)
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